个人的威望也达到了顶峰。可是人们很快就失望了。接收大员变成“劫收”大员，物价不断上涨，内战的威胁也在逼近，山雨欲来，人心惶惶。
资中筠虽然不懂政治，但是她也注意到，家里的大人、亲戚朋友之间对内战的担忧。当马歇尔来华调停国共谈判的消息传来时，“都说这下好了，和谈了，不用打内战了”。也不管是哪边的，都希望最好不要打内战。
资中筠课余学了6年钢琴，1947年高中毕业之时在钢琴老师力主下，举行了个人钢琴演奏会，邀请亲朋好友数百人来助兴，也相当正式。资中筠是老师的三大弟子之一，两个学姐都考取了音乐系，后来成为钢琴教授。但是资中筠的第一喜好并不是音乐，而是数学和文学。但是第一年考清华大学失利，而是被燕京大学录取。
考清华发挥得很不好，特别是长处国文，清华大学的作文是白话《我的中学生活》，很难出彩，而燕京大学的作文是一篇文言文，题目是《立国必先树人，树人必先立德说》。从小学起就写文言文的资中筠自然是得心应手，顺利进入燕京大学数学系，而且免修大一国文，直接读大二国文（那时的学生不论什么系，都必修两年国文）。
燕京大学的校园是美丽的，但是资中筠在这里并不开心。秉承美国教会大学的传统，燕京大学有各种各样的学生团契，不过到那时除了少部分传统的、被认为是右派团契外，绝大部分团契都成为中共地下组织的活动平台，举行传播左派思想的读书会，争取中间同学，以及配合党的其他任务的活动。
资中筠回忆说，“我对这两头都格格不入，都不愿意参加，所以比较孤立”。17岁的资中筠不大善于跟人来往，她经常和一位中学同学在一起。上了一个月数学系的课之后，资中筠发现，数学系里人才济济，自己并非数学天才。反对她学数学的母亲也鼓励她转系，就转到外文系。一年级结业的时候，她毅然地退学，决心再考清华大学。
这一年的暑假，资中筠没有回家，而是每日清晨走进北海边的北平图书馆读书学习。对资中筠来说，这个暑假非常惬意，“上午复习功课以备考试，下午就随便看各种各样的书。那个时候图书馆借书非常容易，管理员态度也非常好，环境安静。我就占一个靠窗口的位子，一看就是一天”。